Spørsmål merket [snakemake]

stemmer
5
svar
4
visninger
515
emacs modus for snakemake?
Publisert på 15/06/2013 klokken 17:08
bruker user2489449
stemmer
0
svar
0
visninger
91
Ugyldig peker og variable ikke er definert feil
Publisert på 11/08/2015 klokken 09:03
bruker Marcel M
Publisert på 24/08/2015 klokken 09:52
bruker rioualen
Publisert på 31/08/2015 klokken 13:40
bruker rioualen
stemmer
3
svar
2
visninger
586
Kjør alltid regelen i Snakefile (snakemake)
Publisert på 08/04/2016 klokken 09:05
bruker Chris
stemmer
2
svar
2
visninger
249
Pipeline programmering i parallell
Publisert på 17/06/2016 klokken 17:21
bruker VickiT05
Publisert på 21/06/2016 klokken 19:27
bruker VickiT05
stemmer
0
svar
1
visninger
912
Omskrive skrivebeskyttet fil
Publisert på 29/06/2016 klokken 12:04
bruker VickiT05
Publisert på 08/07/2016 klokken 06:49
bruker The Unfun Cat
Publisert på 26/10/2016 klokken 10:12
bruker bli
stemmer
3
svar
2
visninger
522
Hvordan gjøre en delvis ekspandere i Snakemake?
Publisert på 03/11/2016 klokken 07:37
bruker bli
Publisert på 09/11/2016 klokken 13:19
bruker bli
Publisert på 09/11/2016 klokken 13:53
bruker user3213137
stemmer
3
svar
2
visninger
1k
Snakemake: navn regelen i stedet for målfilen
Publisert på 10/11/2016 klokken 21:08
bruker blaurent
Publisert på 13/11/2016 klokken 08:13
bruker Stephan
Publisert på 15/11/2016 klokken 03:49
bruker Andreas
Publisert på 17/11/2016 klokken 22:27
bruker olala
Publisert på 18/11/2016 klokken 19:04
bruker olala
Publisert på 21/11/2016 klokken 00:28
bruker Andreas
stemmer
1
svar
1
visninger
121
Forhindre snakemake fra å lage utgang katalog
Publisert på 21/11/2016 klokken 19:36
bruker Harold
Publisert på 22/11/2016 klokken 13:39
bruker Andreas
Publisert på 23/11/2016 klokken 14:43
bruker fitziano
stemmer
2
svar
1
visninger
421
Snakemake: avhengigheter som ikke er inngang
Publisert på 25/11/2016 klokken 08:27
bruker blaurent
Publisert på 02/12/2016 klokken 14:09
bruker bli
Publisert på 02/12/2016 klokken 19:40
bruker olala
stemmer
3
svar
2
visninger
232
Nåværende-regelen navn i Snakemake
Publisert på 05/12/2016 klokken 11:59
bruker glihm
stemmer
1
svar
2
visninger
369
Snakemake: fjern utdatafilen
Publisert på 06/12/2016 klokken 11:30
bruker blaurent
stemmer
3
svar
2
visninger
413
Gjenbruk av en regel i Snakemake
Publisert på 06/12/2016 klokken 14:17
bruker glihm
stemmer
1
svar
1
visninger
55
Installere snakemake uten internett
Publisert på 11/12/2016 klokken 16:36
bruker MichelleN
stemmer
0
svar
1
visninger
89
Snakemake + tmux
Publisert på 11/12/2016 klokken 17:26
bruker domino55
stemmer
-2
svar
1
visninger
171
snakemake LSF problemer
Publisert på 13/12/2016 klokken 10:38
bruker naamako
stemmer
2
svar
0
visninger
146
Snakemake beste praksis for demultipleksing
Publisert på 14/12/2016 klokken 03:57
bruker kdmurrray91
Publisert på 16/12/2016 klokken 11:31
bruker bli
Publisert på 20/12/2016 klokken 17:57
bruker Jon
stemmer
1
svar
0
visninger
60
Definere funksjoner for Geany "Filtype"
Publisert på 04/01/2017 klokken 11:59
bruker Gil Hornung
stemmer
2
svar
0
visninger
344
Bruke regex i snakemake jokertegn
Publisert på 04/01/2017 klokken 12:07
bruker rioualen
Publisert på 12/01/2017 klokken 15:49
bruker vtrubets
stemmer
1
svar
1
visninger
114
Globalt belastning R bibliotekene i Snakemake
Publisert på 13/01/2017 klokken 15:01
bruker Zuup
stemmer
0
svar
1
visninger
528
Hvordan få arbeidskatalogbanen?
Publisert på 16/01/2017 klokken 09:52
bruker rioualen
Publisert på 17/01/2017 klokken 11:55
bruker Robyc
stemmer
1
svar
3
visninger
604
bruke flere parametre i snakemake
Publisert på 20/01/2017 klokken 14:16
bruker Kam Sen
Publisert på 27/01/2017 klokken 14:40
bruker Zuup
Publisert på 15/02/2017 klokken 14:08
bruker bli
Publisert på 21/02/2017 klokken 08:44
bruker Zuup
Publisert på 06/03/2017 klokken 13:42
bruker Mesmer
Publisert på 08/03/2017 klokken 13:27
bruker Veera
Publisert på 16/03/2017 klokken 12:21
bruker bli
Publisert på 16/03/2017 klokken 13:36
bruker lvw
Publisert på 17/03/2017 klokken 05:55
bruker Kolja
stemmer
2
svar
1
visninger
141
`Run` blokk i snakemake reset konfig verdi?
Publisert på 22/03/2017 klokken 03:56
bruker RNA
Publisert på 24/03/2017 klokken 16:18
bruker Veera




Publisert på 28/03/2017 klokken 14:14
bruker lvw
Publisert på 30/03/2017 klokken 15:51
bruker crazyhottommy
Publisert på 10/04/2017 klokken 15:01
bruker Zen
Publisert på 12/04/2017 klokken 14:00
bruker msakya
Publisert på 07/05/2017 klokken 13:43
bruker hetica
Publisert på 11/05/2017 klokken 10:22
bruker tdido
stemmer
1
svar
2
visninger
356
Snakemake SGE Cluster materialet Issue
Publisert på 16/05/2017 klokken 19:56
bruker x.Doan
stemmer
0
svar
0
visninger
47
Får sekvens basert på locus tag ID - SnakeMake
Publisert på 23/05/2017 klokken 09:03
bruker Anna Jeanine
Publisert på 25/05/2017 klokken 00:54
bruker TBoyarski
Publisert på 25/05/2017 klokken 07:22
bruker user3015703
stemmer
2
svar
1
visninger
107
Bruke pyenv i en snakemake regel
Publisert på 01/06/2017 klokken 18:55
bruker rbrisk
Publisert på 07/06/2017 klokken 23:02
bruker TBoyarski
stemmer
2
svar
1
visninger
349
MissinOutputException i snakemake
Publisert på 09/06/2017 klokken 07:32
bruker Jokhe
Publisert på 15/06/2017 klokken 06:23
bruker user3015703
stemmer
1
svar
1
visninger
143
Thread.py feil snakemake
Publisert på 18/06/2017 klokken 13:35
bruker user3015703
Publisert på 22/06/2017 klokken 13:24
bruker user3015703
Publisert på 27/06/2017 klokken 15:52
bruker Jon
stemmer
0
svar
1
visninger
105
Hold deg på Remote S3 RemoteProvider
Publisert på 27/06/2017 klokken 15:56
bruker K.Lai
stemmer
2
svar
1
visninger
649
dynamisk utgang i snakemake
Publisert på 29/06/2017 klokken 00:16
bruker ate50eggs
Publisert på 04/07/2017 klokken 13:04
bruker Alexandre.S
stemmer
1
svar
1
visninger
93
Snakemake: Wrapper kommando logging
Publisert på 12/07/2017 klokken 00:04
bruker sebio
Publisert på 14/07/2017 klokken 20:26
bruker Bruno Grande
Publisert på 21/07/2017 klokken 19:09
bruker Vivek-Bh
Publisert på 25/07/2017 klokken 12:13
bruker mau_who
Publisert på 26/07/2017 klokken 15:58
bruker bli
Publisert på 28/07/2017 klokken 12:34
bruker bli
stemmer
0
svar
1
visninger
38
lenket parametre i SnakeMake
Publisert på 28/07/2017 klokken 20:18
bruker tedtoal
Publisert på 01/08/2017 klokken 15:20
bruker mau_who
Publisert på 03/08/2017 klokken 01:20
bruker TBoyarski
stemmer
-4
svar
2
visninger
69
Hvor å rapportere forslag til SnakeMake
Publisert på 03/08/2017 klokken 17:51
bruker tedtoal
stemmer
1
svar
3
visninger
280
Syntaksen for bruk config data i regler
Publisert på 03/08/2017 klokken 19:34
bruker tedtoal
stemmer
1
svar
2
visninger
739
snakemake jokere eller utvide kommando
Publisert på 04/08/2017 klokken 12:49
bruker mau_who
stemmer
0
svar
0
visninger
156
snakemake tilgang config i produksjonen
Publisert på 04/08/2017 klokken 17:16
bruker Matt
Publisert på 07/08/2017 klokken 17:44
bruker tedtoal
stemmer
1
svar
1
visninger
34
Hvordan er snakemake manuset navn nås?
Publisert på 07/08/2017 klokken 21:33
bruker tedtoal
Publisert på 08/08/2017 klokken 15:39
bruker Zuup
Publisert på 08/08/2017 klokken 19:09
bruker tedtoal
Publisert på 09/08/2017 klokken 09:37
bruker mau_who
stemmer
3
svar
0
visninger
107
Snakemake: dynamisk + ikke-dynamisk utgang
Publisert på 09/08/2017 klokken 19:10
bruker Sean Colby
Publisert på 10/08/2017 klokken 07:09
bruker bli
Publisert på 10/08/2017 klokken 11:33
bruker rioualen
Publisert på 10/08/2017 klokken 22:44
bruker tedtoal
Publisert på 16/08/2017 klokken 12:56
bruker tdido
Publisert på 17/08/2017 klokken 05:39
bruker Jan Schreiber
Publisert på 17/08/2017 klokken 20:08
bruker yevishere
Publisert på 18/08/2017 klokken 19:59
bruker tedtoal
stemmer
0
svar
1
visninger
37
Bracket problem i snakemake klynge kommando
Publisert på 18/08/2017 klokken 20:42
bruker yevishere
stemmer
0
svar
0
visninger
60
arbeidsflyt Frakobling
Publisert på 19/08/2017 klokken 03:58
bruker domino55
Publisert på 21/08/2017 klokken 09:47
bruker merella.stefania
Publisert på 21/08/2017 klokken 15:15
bruker Alistair Miles




Publisert på 21/08/2017 klokken 19:42
bruker yevishere
stemmer
0
svar
1
visninger
115
Lagring av resultat av en skallkommando
Publisert på 28/08/2017 klokken 08:01
bruker khikho
stemmer
1
svar
1
visninger
156
Bruk av argparse i Snakemake script
Publisert på 30/08/2017 klokken 22:57
bruker JeeYem
Publisert på 31/08/2017 klokken 19:44
bruker tedtoal
Publisert på 31/08/2017 klokken 21:54
bruker user977828
Publisert på 05/09/2017 klokken 21:00
bruker tedtoal
Publisert på 06/09/2017 klokken 02:57
bruker mitoRibo
stemmer
0
svar
1
visninger
185
berørings kommando Snakemake
Publisert på 06/09/2017 klokken 09:13
bruker mau_who
Publisert på 08/09/2017 klokken 15:32
bruker hardingnj
stemmer
0
svar
1
visninger
39
Proxy-fil på snakemake kode
Publisert på 11/09/2017 klokken 13:11
bruker mau_who
stemmer
2
svar
1
visninger
187
Flere "params" i Snakemake fil
Publisert på 13/09/2017 klokken 09:00
bruker Michael Schubert
Publisert på 13/09/2017 klokken 12:06
bruker Michael Schubert
stemmer
0
svar
1
visninger
54
Snakemake: regel generere merkelige resultater
Publisert på 19/09/2017 klokken 11:53
bruker user4249654
stemmer
0
svar
1
visninger
86
snakemake hvordan å kode par analisys
Publisert på 19/09/2017 klokken 20:56
bruker mau_who
Publisert på 25/09/2017 klokken 05:25
bruker tedtoal
stemmer
0
svar
1
visninger
129
Snakemake regler
Publisert på 25/09/2017 klokken 05:43
bruker jk_kim
Publisert på 25/09/2017 klokken 19:18
bruker mau_who
Publisert på 26/09/2017 klokken 11:51
bruker mgalardini
Publisert på 26/09/2017 klokken 12:36
bruker Rewati Tappu
stemmer
0
svar
1
visninger
217
Input joker Begrensninger Snakemake
Publisert på 30/09/2017 klokken 23:58
bruker Mike Dacre
Publisert på 02/10/2017 klokken 14:45
bruker hardingnj
Publisert på 04/10/2017 klokken 00:24
bruker bwubb
stemmer
2
svar
2
visninger
233
Håndtering SIGPIPE feil i snakemake
Publisert på 04/10/2017 klokken 14:56
bruker dariober
stemmer
0
svar
1
visninger
72
Tid ventetid for snakemake
Publisert på 06/10/2017 klokken 11:00
bruker mau_who
Publisert på 08/10/2017 klokken 16:12
bruker sharchaea
Publisert på 08/10/2017 klokken 21:50
bruker tedtoal
Publisert på 12/10/2017 klokken 15:25
bruker David M
Publisert på 13/10/2017 klokken 15:08
bruker bwubb
stemmer
2
svar
1
visninger
183
Betydning av referanse variabler i snakemake
Publisert på 18/10/2017 klokken 14:03
bruker bli
Publisert på 19/10/2017 klokken 06:17
bruker Kim
Publisert på 20/10/2017 klokken 18:23
bruker Sajber
Publisert på 20/10/2017 klokken 19:14
bruker Colin
stemmer
1
svar
1
visninger
196
SLURM / Sbatch skaper mange små utmatingsfiler
Publisert på 24/10/2017 klokken 09:32
bruker Sajber
stemmer
0
svar
1
visninger
105
Rekursjon / looping av reglene i snakemake
Publisert på 26/10/2017 klokken 05:38
bruker Cerikson
stemmer
1
svar
0
visninger
220
Hvordan bruke miljøet per regelen i snakemake?
Publisert på 26/10/2017 klokken 06:43
bruker A. Fust
stemmer
0
svar
1
visninger
27
Ignorer / No-bruk klynge for visse regler
Publisert på 27/10/2017 klokken 12:03
bruker bwubb
Publisert på 03/11/2017 klokken 00:44
bruker SlowLearner
stemmer
0
svar
0
visninger
58
snakemake filtrere dynamiske filer
Publisert på 03/11/2017 klokken 08:23
bruker Fenrir
Publisert på 03/11/2017 klokken 16:22
bruker bli
Publisert på 07/11/2017 klokken 00:21
bruker Cerikson
stemmer
1
svar
0
visninger
57
Sikre en jobb per node for en bestemt regel
Publisert på 07/11/2017 klokken 13:03
bruker ezhao15
Publisert på 09/11/2017 klokken 19:47
bruker mau_who
Publisert på 10/11/2017 klokken 02:16
bruker tedtoal
stemmer
1
svar
1
visninger
95
Hvordan få conda miljøet banen inni en regel?
Publisert på 12/11/2017 klokken 10:44
bruker pirovc
Publisert på 13/11/2017 klokken 13:15
bruker Carlus
Publisert på 13/11/2017 klokken 14:32
bruker Carlus
Publisert på 15/11/2017 klokken 18:12
bruker JeeYem
Publisert på 15/11/2017 klokken 21:46
bruker dugar
stemmer
1
svar
0
visninger
23
Aktivere alternativer i snakefile
Publisert på 20/11/2017 klokken 15:52
bruker tedtoal
Publisert på 20/11/2017 klokken 21:13
bruker Barry Moore




Publisert på 21/11/2017 klokken 12:20
bruker Kamil S Jaron
Publisert på 24/11/2017 klokken 07:57
bruker rioualen
Publisert på 29/11/2017 klokken 12:50
bruker l0o0
Publisert på 01/12/2017 klokken 17:49
bruker JeeYem
Publisert på 04/12/2017 klokken 12:55
bruker fiona
stemmer
0
svar
0
visninger
142
hvordan å jokertegn i regler, Snakemake
Publisert på 04/12/2017 klokken 17:52
bruker Yan W.
Publisert på 05/12/2017 klokken 02:14
bruker Hirak Sarkar
stemmer
1
svar
0
visninger
43
For mange filer i `.snakemake` mappe
Publisert på 12/12/2017 klokken 10:24
bruker Jan Schreiber
stemmer
0
svar
0
visninger
22
hvordan å finne den rette oppbevarings
Publisert på 13/12/2017 klokken 23:56
bruker Anlin Li
stemmer
0
svar
1
visninger
95
Snakemake ett wildcard og utvide
Publisert på 18/12/2017 klokken 14:36
bruker par
stemmer
2
svar
0
visninger
52
Snakemake: gå tilbake og rydde opp temp (filer)
Publisert på 19/12/2017 klokken 12:29
bruker Jonathan Manning
Publisert på 19/12/2017 klokken 17:33
bruker Bharat
stemmer
0
svar
1
visninger
66
snakemake forskjellige miljøer pr subworkflow
Publisert på 22/12/2017 klokken 07:32
bruker Tjitske
stemmer
1
svar
1
visninger
104
Tilgang nestet config variabler i en regel
Publisert på 28/12/2017 klokken 04:29
bruker Daniel Standage
Publisert på 28/12/2017 klokken 12:15
bruker rioualen
Publisert på 05/01/2018 klokken 06:37
bruker Anlin Li
Publisert på 05/01/2018 klokken 09:05
bruker rioualen
stemmer
1
svar
1
visninger
126
Mangler jokere i S4 snakemake objekt i R
Publisert på 05/01/2018 klokken 15:08
bruker Patrick Roelli
Publisert på 09/01/2018 klokken 10:18
bruker Chris
Publisert på 09/01/2018 klokken 16:16
bruker fakechek
stemmer
0
svar
1
visninger
133
utgangspunktet ikke plukket opp av snakemake
Publisert på 10/01/2018 klokken 13:29
bruker yahan
Publisert på 11/01/2018 klokken 19:16
bruker user1973192
Publisert på 15/01/2018 klokken 11:00
bruker Julien Lagarde
Publisert på 19/01/2018 klokken 13:57
bruker Uri Laserson
stemmer
1
svar
0
visninger
58
lambda-ekspresjon på inndataargumenter
Publisert på 21/01/2018 klokken 14:16
bruker khikho
Publisert på 24/01/2018 klokken 02:18
bruker Andreas
Publisert på 24/01/2018 klokken 12:03
bruker tfenne
Publisert på 25/01/2018 klokken 07:55
bruker yahan
Publisert på 25/01/2018 klokken 08:17
bruker fakechek
stemmer
1
svar
2
visninger
268
Bruke flere filnavn som jokertegn i Snakemake
Publisert på 25/01/2018 klokken 11:03
bruker bapors
Publisert på 25/01/2018 klokken 17:50
bruker seandavi
Publisert på 28/01/2018 klokken 14:35
bruker Lucas van Dijk
stemmer
1
svar
1
visninger
100
Snakemake minne begrense
Publisert på 31/01/2018 klokken 10:33
bruker bapors
Publisert på 01/02/2018 klokken 01:00
bruker Mike Dacre
Publisert på 01/02/2018 klokken 15:07
bruker anilbey
stemmer
1
svar
0
visninger
21
Snakemake: multi-level json parsing
Publisert på 06/02/2018 klokken 07:24
bruker Nicolas Rosewick
Publisert på 07/02/2018 klokken 15:30
bruker user9328894
Publisert på 07/02/2018 klokken 17:02
bruker Thomas Moody
Publisert på 08/02/2018 klokken 10:37
bruker anilbey
stemmer
1
svar
1
visninger
97
InputFunctionException med KeyError
Publisert på 09/02/2018 klokken 14:08
bruker user3015703
Publisert på 09/02/2018 klokken 18:34
bruker K.Lai
stemmer
0
svar
1
visninger
32
snakemake inngangsfunksjonsmerkelige resultater
Publisert på 09/02/2018 klokken 18:36
bruker mau_who
stemmer
1
svar
1
visninger
85
Snakemake: Feil med ikke eksisterende wildcard
Publisert på 12/02/2018 klokken 11:35
bruker Nicolas Rosewick
Publisert på 14/02/2018 klokken 08:03
bruker user9328894
stemmer
0
svar
1
visninger
88
snakemake gruppere filer sammen med wildcard
Publisert på 14/02/2018 klokken 09:32
bruker Nicolas Rosewick
stemmer
1
svar
0
visninger
90
hierarkisk dynamisk utgang i snakemake
Publisert på 15/02/2018 klokken 10:08
bruker kiero
stemmer
0
svar
1
visninger
58
Snakemake ikke spiller pent med wget
Publisert på 15/02/2018 klokken 22:35
bruker conchoecia
Publisert på 20/02/2018 klokken 13:21
bruker Nicolas Rosewick
stemmer
0
svar
1
visninger
132
skape snakemake jokertegn manuelt
Publisert på 21/02/2018 klokken 13:09
bruker fakechek

Cookies help us deliver our services. By using our services, you agree to our use of cookies. Learn more